鸡的消化道相对较短，肠粘膜屏障脆弱。在集约化养殖条件下，与消化道较长的动物相比，它们更容易受到有害微生物的影响，导致各种疾病。饲料添加剂的使用是防治肠道疾病、提高肉鸡和蛋鸡生产性能的有效手段之一。肉鸡生长速度快，集约化生产中受环境影响大。饲料添加剂的应用可以改善肠道菌群平衡，降低肠道疾病的发病率和死亡率，增加屠宰重，降低料肉比，减少鸡舍氨、硫化氢等有害气体的排放，提高产品质量。饲料添加剂在蛋鸡蛋鸡养殖中应用，不仅可以预防疾病，提高生产性能和饲料报酬，而且可以提高鸡蛋品质。研究表明，在蛋鸡饲粮中添加饲料添加剂可以增加鸡蛋的哈氏单位，降低鸡蛋的胆固醇含量，具有提高蛋壳厚度和减少软壳蛋的效果。

目前的研究和应用表明，饲料添加剂在仔猪、母猪和肥育猪的育种中取得了良好的应用效果。在仔猪饲粮中添加饲料添加剂可促进仔猪肠道发育，改善肠道健康，降低腹泻率，提高仔猪生长速度和饲料转化率。对于哺乳期仔猪，添加饲料添加剂有助于建立益生菌的优势菌群;对断奶仔猪，可改善因仔猪自身消化酶分泌和饲粮抗原性等因素引起的腹泻和生长迟缓的不良影响。研究表明，在母猪饲粮中添加饲料添加剂可以改善母猪肠道健康，提高母猪免疫力和繁殖性能。添加饲料添加剂后，可提高调节胃肠道菌群平衡的能力，增加母猪哺乳期采食量，抑制体重下降，增加母猪乳中脂肪和蛋白质含量，提高断奶仔猪成活率和断奶仔猪体重。在育肥猪饲粮中添加饲料添加剂，可提高采食量和饲料转化率，改善健康，缩短育肥期，具有提高品质、减少环境污染的作用。研究表明，添加饲料添加剂可降低育肥猪的腹泻率，提高免疫力，增加采食量和饲料消化率，从而提高饲粮利用率，降低料肉比。此外，饲料添加剂对增加肌内脂肪和增加必需脂肪酸含量有一定的促进作用，可以提高猪肉品质。

研究表明，饲料添加剂可以提高肉用反刍动物如肉羊、肉牛的增重率，提高胴体净肉率，改善肉质。对于产奶反刍动物，饲料添加剂可以增加产奶量，延长产奶高峰，提高乳脂率，减少乳中体细胞数量，改善乳成分。对乳腺炎和生殖疾病的防治也有一定的效果。对于消化道发育不完全的犊牛，使用添加剂可以促进犊牛胃肠道菌群的建立，调节菌群的平衡，减少犊牛腹泻的发生。此外，饲料添加剂的使用可以促进犊牛增重。

饲料添加剂在水产品中的应用主要体现在饵料和水质净化两个方面。饲料添加剂可以改善水生动物的微生态平衡，促进生长发育，起到防治疾病和提高生产性能的作用。益生菌可定植于鱼类肠道内，促进鱼类生长发育，提高抗病性。饲料添加剂可以降低对虾的发病率，提高成活率和产量。饲料添加剂可作为水产动物的免疫刺激剂和佐剂，促进免疫器官的发育，提高体液免疫水平，提高免疫功能。这种效果已在多种水生动物身上得到验证。饲料添加剂中的光合细菌和硝化细菌可以消耗水体中的有机物，去除氨氮、硫化氢、亚硝酸盐氮等，是目前应用于改善养殖环境的重要有益微生物。在育种中取得了良好的应用效果。